진올바이오테크놀러지 (GeneAll Biotechnology)

10 Viral/Pathogen Detection: Cell viral DNA/RNA: Ribospin™ Pathogen/TNA kit는 세균 및 바이러스에 감염된 다양한 종류의 검체에서 병원체(pathogen)의 total nucleic acids(TNA)를 추출하기 위한 제품입니다. 비유기용매(non-phenol) 및 silica-based extraction method의 제품으로 쉽고 빠르게 pathogen TNA를 추출할 수 있습니다. 추출된 pathogen TNA는 PCR, quantitative PCR(qPCR), reverse transcription PCR(RT-PCR) 등 다양한 downstream application에 적용 가능합니다.
이 application note에서는 Ribospin™ Pathogen/TNA 제품의 추출 성능을 평가했습니다. 성능 평가를 위해 네 종류의 병원체(Mycoplasma Gallisepticum;MG, Infectious Bronchitis Virus;IBV, Japanese encephalitis virus;JEV, Rabies virus;RV)를 인위 감염시킨 K562 세포주 검체와 이를 serial dilution한 검체를 핵산 추출에 사용했습니다. MG, IBV를 인위 감염시킨 검체에서 추출된 TNA는 qPCR을 수행했으며 JEV, RV를 인위 감염시킨 검체에서 추출된 TNA는 RT-PCR 수행 후 전기영동을 통해 각각의 민감도를 확인하여 추출 성능을 평가했습니다.

Application Notes: Performance evaluation of Ribospin™ Pathogen/TNA from 4 types of pathogen

Products: Ribospin™ Pathogen/TNA

12 Viral/Pathogen Detection: Fecal DNA: 분변에는 호스트의 유전자 정보뿐만 아니라 다양한 장내 미생물의 메타게놈(metagenome)이 존재하며, 용의자 신원 검출, 반려동물 추적, 치료제 개발, 건강 기능 식품 제조 등 다양한 분야에서 활용되는 소재 중 하나입니다. 장내 미생물의 경우 프로바이오틱스와 더불어 잠재력이 우수한 산업 또는 연구 분야 중 하나로 꼽히고 있습니다.
AllEx® Fecal DNA/RNA Kit는 다양한 유형의 분변 속에 존재하는 호스트와 미생물의 DNA/RNA를 추출하기 위한 제품입니다. 이 제품은 자동화 핵산 추출 장비 중 하나인 AllEx®64의 전용 키트이며, magnetic bead-based technology를 기반으로 신속하고 빠르게 핵산 추출을 진행합니다. 추출된 핵산은 동정, 감염 진단, 유전자 분석, 마이크로바이옴 연구 등을 위한 PCR, sequencing, NGS 등의 다양한 downstream application에 적용할 수 있습니다.
이 application note는 다양한 유형의 분변 시료에서 AllEx® Fecal DNA/RNA Kit를 이용하여 핵산을 추출한 후 수율 및 순도를 측정하고 real-time PCR을 통해 성능을 평가한 내용이며, 타사의 매뉴얼 핵산 추출 키트와 함께 결과를 비교하였습니다.

Application Notes: Genomic DNA Extraction from fecal samples using AllEx® Fecal DNA/RNA Kit

Products: AllEx®64 Automated Nucleic Acid Extraction System

AllEx® Fecal DNA/RNA Kit

11 Viral/Pathogen Detection: Whole blood viral DNA/RNA: 전염성 기관지염(Infectious bronchitis;IB)은 주로 가금류에 호흡기 질병 또는 연각란, 무각란, 기형란 및 산란 저하 등의 산란 이상 질병을 유발합니다. IB의 원인체는 Infectious bronchitis virus(IBV)이며, Mycoplasma sp.에 의한 복합 만성 호흡기병(Complicated chronic respiratory disease;CCRD)에 의해서도 유발될 수 있습니다. 전염성 기관지염은 전파력이 강해 단시간에 집단 발병을 일으켜 농가에 큰 피해를 주는 질병입니다. 그러므로 질병 확산 억제를 위해서는 정확한 진단검사를 통한 신속한 발병 여부 파악이 중요합니다.
Ribospin™ Pathogen/TNA kit는 세균 및 바이러스에 감염된 다양한 종류의 검체에서 병원체(pathogen)의 total nucleic acids(TNA)를 추출하기 위한 제품입니다. 비유기용매(non-phenol) 및 silica-based extraction method의 제품으로 쉽고 빠르게 pathogen TNA를 추출할 수 있습니다. 추출된 pathogen TNA는 PCR, quantitative PCR(qPCR), reverse transcription PCR(RT-PCR) 등 다양한 downstream application에 적용 가능합니다.
이 application note에서는 Ribospin™ Pathogen/TNA 제품과 타사 바이러스/병원체 추출 키트 두 가지의 추출 성능을 비교 평가했습니다. 두 종류의 병원체(Mycoplasma Gallisepticum;MG, Infectious Bronchitis Virus;IBV)를 인위 감염시킨 수탉의 전혈에서 TNA를 추출 후 qPCR을 수행하여 각 추출 키트의 추출 성능을 비교 평가했습니다.

Application Notes: Comparison data of Ribospin™ Pathogen/TNA with other commercial kits from pathogen-infected rooster whole blood

Products: Ribospin™ Pathogen/TNA

09 Viral/Pathogen Detection: Comparison data: 마이코플라즈마 감염증은 Mycoplasma spp.에 의해 발병되는 질환으로 조류를 중심으로 만성호흡기 질병(Chronic respiratory disease : CRD), 관절활막염 등의 질병을 유발합니다. 또한, 호흡 기관의 병원체에 대한 저항력/면역력을 떨어트려 다른 호흡기 질환을 유발하는 세균 및 바이러스에 의한 복합만성호흡기병(Complicated chronic respiratory disease : CCRD)을 유발하는 질병이기도 합니다.
마이코플라즈마 균은 약 20 여종이 있으며, 그 중 Mycoplasma gallisepticum와 Mycoplasma synoviae 는 닭에 대한 병원성이 높아 많은 축산 농가에 경제적인 피해를 입히는 원인 중 하나입니다. 육안적 소견만으론 마이코플라즈마 균을 다른 병원체와 특정하기가 쉽지 않기 때문에 혈청학적 방법 또는 유전자적접근 방법을 통해 정확하게 특정하고 진단해야 하는 병원체 중 하나입니다. 이 감염증은 수평적 또는 수직적인 경로를 통해 병원체가 배출되어 계군 내 집단 감염을 빠르게 유발할 수 있으므로 신속하고 정확하게 마이코플라즈마 병원체를 특정하고 진단하는 것은 감염 확산을 예방하는데 매우 중요한 과정 중 하나입니다. 또한, 신속하고 정확하게 진단이 이루어질 수 있도록 뒷받침해주는 기술 또한 감염 확산 예방에 있어 중요한 요소 중 하나입니다.
이번 내용은 두 가지 종류의 병원체에 감염된 수탉으로부터 면봉을 이용하여 구강상피세포를 채취 후 Exgene™ Viral DNA/RNA kit와 타사의 viral/pathogen nucleic acid extraction kit 2종으로 핵산을 추출하였습니다. 이후 각 제조사 별 viral/pathogen nucleic acid extraction kit의 성능 평가를 위해 추출된 핵산을 template로 사용하였으며, real-time PCR을 수행하여 핵산 추출 성능을 비교/평가하였습니다.
Exgene™ Viral DNA/RNA kit는 다양한 바이러스/병원체 감염 샘플에서 고품질의 total nucleic acid를 쉽고 빠르게 정제할 수 있으며, 추출된 핵산을 이용하여 유전자 진단 방법을 통해 신속하고 정확하게 바이러스/병원체 감염 여부를 판단할 수 있는 제품입니다.

Application Notes: Performance comparison of Exgene™ Viral DNA/RNA and competitors’ kits from buccal swab of pathogen-infected rooster

Products: Exgene™ Viral DNA/RNA

08 Viral/Pathogen Detection: Comparison data: 동물을 매개로 하는 병원체는 비말, 분뇨, 소변 등 다양한 경로를 통해 체외로 배출되고, 특히 가축 분뇨는 가축전염병의 주된 전파경로 중의 하나로 작용하고 있습니다. 가축전염병의 예방과 확산을 막기 위해서는 가축 분뇨에 대한 엄격한 관리가 가장 중요합니다.
가축전염병 중 조류 인플루엔자(Avian Influenza, AI)는 가축전염병 중 조류에 발병하는 전염성 호흡기 질환이며 인간에게 옮을 가능성은 낮지만 옮으면 치사율이 높은 전염병입니다. 우리나라에서는 2003년에 처음 발병된 이후 꾸준하게 고병원성 AI가 발생하고 있으며 최근에는 고양이에서도 감염 사례가 보고되고 있습니다. 조류 인플루엔자는 주로 직접접촉에 의해서 전파되며, 감염된 닭의 분변 1g에는 100,000~1,000,000 마리의 닭을 감염시킬 수 있는 고농도의 바이러스가 포함되어 있습니다. 이러한 분변이 오염된 차량이나 사람, 사료, 사양 관리기구 등을 통해 전파되며 오염된 쥐나 야생 조류에 의해서도 전파될 수 있습니다.
조류 인플루엔자 진단은 항원검출법과 혈청학적 진단법이 있으며, 현재 우리나라에서는 보다 신속한 진단을 위하여 역전사중합효소연쇄반응(RT-PCR)기법을 이용한 바이러스 검출 및 동정을 실시하고 있으며, 세계동물보건기구의 권장 검사방법인 종란접종 후 혈구응집반응 검사 및 혈청형 동정, 병원성 규명 등 항원검출 방법과 병행하고 있습니다.
중합효소연쇄반응(PCR)과 같은 분자진단검사 방법은 감염 경로 내 병원체를 특정하는 중요한 기술 중 하나입니다. 하지만, 분변과 같은 검체 내에 다량으로 존재하는 수많은 물질 중 PCR 반응을 저해하는 PCR inhibitor가 포함되어 있어, 이를 제거하여 순수한 핵산만을 추출하는 기술은 정확한 분자진단검사를 하기 위한 중요한 요소 입니다.
Exgene™ Viral DNA/RNA kit와 타사의 viral/pathogen nucleic acid extraction kit 2종을 이용하여 두 가지 종류의 병원체에 감염된 수탉의 분변으로부터 핵산을 추출하였습니다. 이후 각 제조사 별 kit의 성능 평가를 위해 추출된 핵산을 template로 사용하였으며, real-time PCR을 수행하여 핵산 추출 성능을 비교/평가하였습니다.
Exgene™ Viral DNA/RNA kit는 다양한 바이러스/병원체 감염 샘플에서 고품질의 total nucleic acid를 쉽고 빠르게 정제할 수 있으며, 추출된 핵산을 이용하여 유전자 진단 방법을 통해 신속하고 정확하게 바이러스/병원체 감염 여부를 판단할 수 있는 제품입니다.

Application Notes: Comparison of Exgene™ Viral DNA/RNA kit to other commercial kits for pathogen nucleic acid extraction from rooster stool

Products: Exgene™ Viral DNA/RNA

07 Viral/Pathogen Detection: Comparison data: 가금류의 호흡기 질병을 유발하는 바이러스 또는 병원성 박테리아는 가금류에 심각한 발육 저하, 산란율 저하, 만성 폐사 및 무산란증과 같은 질병을 유발하여 매년 농가에 막대한 피해를 입히고 있습니다. 호흡기 질병은 그 특성상 발병 수일 이내로 계군 전체를 감염시킬 수 있고 외부로 확산할 수 있습니다. 혈액 검사 또는 유전자 접근 방법 등은 병원체의 발병 여부를 진단하고 특정하여 감염의 확산을 막거나 예방하는데 매우 중요한 역할을 수행합니다. 혈액 검사나 유전자 접근 방법에 있어 신속/정확성은 감염의 확산을 막고 예방하는데 결정적이고 중요한 요소입니다.
Exgene™ Viral DNA/RNA kit와 타사의 viral/pathogen nucleic acid extraction kit 2종을 이용하여 두 가지 종류의 병원체에 감염된 수탉의 전혈로부터 핵산을 추출하였습니다. 이후 각 제조사 별 viral/pathogen nucleic acid extraction kit의 성능 평가를 위해 추출된 핵산을 template로 사용하였으며, real-time PCR을 수행하여 핵산 추출 성능을 비교/평가하였습니다.
Exgene™ Viral DNA/RNA kit는 다양한 바이러스/병원체 감염 샘플에서 고품질의 total nucleic acid를 쉽고 빠르게 정제할 수 있으며, 추출된 핵산을 이용하여 유전자 진단 방법을 통해 신속하고 정확하게 바이러스/병원체 감염 여부를 판단할 수 있는 제품입니다.

Application Notes: Comparison of Exgene™ Viral DNA/RNA kit to other commercial kits for pathogen nucleic acid extraction from rooster whole blood

Products: Exgene™ Viral DNA/RNA

06 Viral/Pathogen Detection: Comparison data: 병원성 박테리아(pathogenic bacteria)에 대한 치료 및 연구는 우수한 성과를 이루고 있는 반면, 병원성 바이러스(pathogenic virus)에 대한 치료 및 연구는 매우 빠른 변이 특성으로 인하여 즉각적인 진단과 치료의 적용이 어려운 분야입니다.
Virus는 보유한 핵산의 종류에 따라 크게 DNA virus와 RNA virus로 나뉘는데, 핵산의 종류와 형태에 따라 각 바이러스의 특성이 상이하며, 특히 RNA virus는 RNA의 돌연변이로 인하여 쉽게 변이되는 특성을 가지고 있습니다.
바이러스는 같은 뿌리에서 시작하더라도 변이로 인하여 나뭇가지처럼 다양한 분화가 빠르게 진행되므로, 바이러스 유전체 및 변이 연구는 신속하면서도 지속적으로 진행되어야 하며, 바이러스 유전체와 바이러스 단백질에 대한 분석 및 연구는 백신 개발 및 치료 메커니즘의 바탕이 되므로 바이러스 연구에서 중요한 요소라고 할 수 있습니다.
Exgene™ Viral DNA/RNA Kit는 다양한 viral sample에서 고품질의 DNA/RNA를 추출하여 다양한 downstream application에 적용할 수 있도록 개발된 제품입니다. 이번 application note는 널리 알려져 있는 주요 병원체 sample을 이용하여 자사 Exgene™ Viral DNA/RNA Kit와 타사 제품(2종)의 핵산 추출 성능 비교 및 sample의 serial dilution을 통한 Exgene™ Viral DNA/RNA Kit의 성능 검증을 진행한 내용입니다.

Application Notes: Comparison of the Pathogen Purification Performance of Exgene™ Viral DNA/RNA to Other Commercial Kits

Products: Exgene™ Viral DNA/RNA

05 Viral/Pathogen Detection: Buccal swab viral DNA/RNA: 호흡기관 또는 기관지에 발생하는 질병인 호흡기 질환은 가장 흔하게 발병하는 질병으로 감염성질환, 기도 관련 질환, 악성 종양 등이 주요 질환으로 알려져 있습니다.
그 중, 감염성 호흡기 질환의 주요 원인은 virus이며, influenza나 corona virus 등과 같이 감염률과 감염 유행성이 높은 질병입니다. 일반적으로 감염성 호흡기 질환에 대한 검체 채취는 swab을 이용한 구인두도말 또는 비인두도말 방식을 사용합니다. 2015년 MERS(메르스) 및 2020년 COVID-19의 대유행으로 인해 감염성 호흡기 질환의 진단 및 치료를 위한 수요가 폭발적으로 증가하자, 이를 대량으로 처리가 가능한 자동화 핵산 추출 장비 및 제품에 대한 관심이 높아지게 되었습니다.
GENTi™ 32 Advanced Automatic Nucleic Acid Extraction System과 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit는 다양한 검체로부터 viral 및 pathogen DNA/RNA를 추출 가능하며, 이 Application note는 조류의 호흡기 질병 병원체(Mycoplasma gallisepticum, Infectious bronchitis virus)에 감염된 rooster의 구강에서 cotton swab으로 검체를 채취한 뒤 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit와 타사 제품을 이용하여 추출한 결과를 비교한 내용입니다.

Application Notes: Comparison of Automatic Nucleic Acid Extraction Kit and Manual Nucleic Acid Extraction Kit from Buccal Swab of Pathogen-infected Rooster

Products: GENTi™ 32 Advanced Automatic Extraction Equipment

GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit

04 Viral/Pathogen Detection: Stool viral DNA/RNA: 병원체에 감염되는 감염 경로는 매우 다양하게 존재합니다. 그 중, 몇몇 병원체는 감염된 생명체가 배설한 분변을 통해 체외로 배출 되고 그것을 접촉한 대상을 교차 감염을 일으키기도 하므로 분자진단검사에 사용되는 다양한 임상 검체 중 하나입니다.
분변 검체로 감염 여부를 진단하는 방법은 분자진단검사 기법 중 하나인 Real-time PCR (qPCR) 또는 Real-time RT-PCR (qRT-PCR) 기법을 통해 판별이 가능합니다. 하지만, 분변 검체 속에 다량 존재하는 PCR inhibitor는 PCR 수행 시 방해 요소로 작용하기 때문에 분자진단 검체 중 까다로운 편에 속합니다. 분변 검체 속에 존재하는 PCR inhibitor를 제거하고 동시에 순수한 핵산만을 추출하는 기술은 정확한 분자진단검사를 하기 위한 중요한 기술 중 하나입니다.
GENTi™ 32 Advanced Automatic Extraction System과 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit는 분변 검체 내 존재하는 PCR inhibitor를 효과적으로 제거할 수 있으며 다양한 병원체의 핵산 추출이 가능한 제품입니다. 이번 application note는 인위로 감염된 분변 검체를 GENTi™ 32 Advanced Automatic Extraction System과 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit를 사용하여 Mycoplasma gallisepticum (MG)과 Infectious bronchitis virus (IBV)의 고순도 핵산을 추출한 후 Real-time PCR (qPCR)과 qRT-PCR를 통하여 확인한 결과입니다.

Application Notes: High-quality Nucleic Acids from Pathogen-infected Stool Samples with GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit

Products: GENTi™ 32 Advanced Automatic Extraction Equipment

GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit

03 Viral/Pathogen Detection: Whole blood viral DNA/RNA: 감염된 전혈(infected whole blood)은 병원체의 핵산을 추출하는데 자주 이용되는 검체이지만, 양질의 핵산 추출을 방해하는 혈색소(heme), 항응고제(EDTA 또는 heparin), 백혈구 및 기타 물질 등의 inhibitor를 다수 포함하고 있기 때문에 핵산 추출 시 inhibitor 제거 기술이 가장 중요합니다. 또한, 분자진단검사를 하기 위해서는 검체로부터 고순도의 핵산을 추출하고 효율적으로 처리하는 것도 중요합니다. 이러한 요소는 분자진단 시장이 성장하면서 더욱더 핵심 기술로 자리잡게 되었습니다. 그러므로 자동화 핵산 추출 시스템은 다량의 업무 흐름을 효율적으로 처리하고 양질의 핵산을 추출 하는데 중요한 위치를 차지하게 됐습니다.
Magnetic bead technology 기반의 GENTi™ 32 Advanced Automatic Extraction System과 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit는 inhibitor가 다수 존재하는 혈액 검체로부터 high-quality의 병원체 DNA/RNA 추출이 가능한 제품입니다. 해당 자료는 인위 감염시킨 전혈을 GENTi™ 32 Advanced Automatic Extraction System와 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit로 추출한 DNA/RNA를 template로 사용하여 qPCR과 qRT-PCR를 통하여 증폭을 확인한 결과입니다.

Application Notes: Automated purification of high-quality pathogen DNA/RNA from infected whole blood using GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit

Products: GENTi™ 32 Advacned Automatic Extraction Equipment

GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit

02 Viral/Pathogen Detection: Viral DNA/RNA: 바이러스(virus)와 병원성 세균(pathogenic bacteria)는 동물, 식물, 박테리아 등 여러 생명체를 감염시키고 질병을 일으킵니다. 특히, 높은 변이율과 감염성을 가진 바이러스는 다양한 계통에서 여러 가지 질환을 일으키는 질병의 원인 중 하나입니다.
이번 application note에 소개드릴 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit는 magnetic bead 기반의 자동화 핵산 추출 장비와 함께 사용 가능하며, 다양한 sample로부터 viral DNA/RNA를 신속하게 추출이 가능합니다. 특히, 세계적인 pandemic을 일으킨 COVID-19의 viral RNA를 추출하고자 여러 각국(말레이시아, 태국, 파키스탄, 체코, 파라과이 등)에서 사용하고 있는 제품입니다.
본 application note는 magnetic bead type의 자동화 핵산 추출 장비(GENTi™ 32 Advanced Automatic Extraction System)와 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit를 이용하여 널리 알려져 있는 바이러스(IBV, RV, JEV)와 박테리아(MG)로부터 DNA/RNA를 추출하여 downstream application에 적용한 결과입니다.

Application Notes: Efficient purification of high quality viral nucleic acids from a wide range of sample materials using GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit

Products: GENTi™ 32 Advacned Automatic Extraction Equipment

GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit

01 Viral Detection: Viral DNA/RNA: GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit는 바이러스 혹은 숙주 세포를 포함한 cell-free fluid, cell culture supernatant, plasma, serum, nasal swab, urine 등과 같은 다양한 임상 sample로부터 핵산을 정제하도록 설계된 체외 진단 의료기기입니다.
GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit는 magnetic bead를 이용한 자동화 핵산 정제 기술을 이용해 DNA 및 RNA를 가장 빠르고 편리하게 정제할 수 있습니다.
GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit의 buffer system은 고도로 최적화되었으며, 사용자 편의를 위해 다양한 임상 sample에서 핵산을 추출할 수 있는 범용성을 제공합니다. 대부분의 sample은 전처리 단계를 생략하거나 최소화하여 핵산 정제에 사용할 수 있습니다. 정제된 DNA 및 RNA는 추가 조작 없이 다양하게 활용 가능합니다.
GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit는 실온에서 사용 및 보관해야 합니다. 추출된 RNA는 일반 실험실 용품 및 먼지에서 흔히 발견되는 RNase와 같은 오염 물질에 취약하므로 특별한 주의를 요구하며 적절한 장비로 처리해야 합니다. RNA 안정성을 위해서는 RNA를 4°C에 보관하여 즉시 분석에 사용하거나, -70°C 이하에서 장기 보관하는 것이 좋습니다.

Application Notes: Rapid, Automated and High-Performance DNA/RNA Extraction

Products: GENTi™ 32 Advacned Automatic Extraction Equipment

GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit

진올바이오테크놀러지

APPLICATIONS

VIRAL/PATHOGEN DETECTION