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Fishery:
Halophyte DNA - 자연에는 일반 환경과는 다른 독특한 환경에서 살아가는 식물들이 다수 존재합니다. 그 중, 염생식물(Halophyte)은 연안 습지, 사구, 염전 등 염분이 존재하는 환경에서 생활하는 식물이며, 대표적으로 세발나물(Spergularia marina), 칠면초(Suaeda japonica), 해홍나물(Suaeda maritima) 및 퉁퉁마디(Salicornia europaea) 등이 있습니다. 염생식물은 염분 수요 유무, 서식 환경 또는 생리적 특성 등 학자마다 염생식물을 분류하는 기준이 다르며, 주로 식품 또는 의약품 분야에서 식용 또는 약용 자원으로 활용됩니다. 염생식물 내 축적된 염분과 다당류는 핵산 추출 효율을 크게 감소하는 시키는 요인 중 하나로 유전자 연구에 있어 다루기 힘든 소재 중 하나입니다.
Exgene™ Plant SV는 다양한 식물 조직으로부터 genomic DNA 추출을 위한 제품이며, 사용되는 샘플량에 맞춰 mini, midi 및 maxi scale을 선택할 수 있습니다. 이 제품은 식물 내 핵산 추출 효율을 감소시키는 다당류 및 cell debris를 EzSep™ Filter를 통해 효과적으로 제거하여 고품질의 genomic DNA 추출이 가능한 제품이며, 추출된 genomic DNA는 다양한 downstream application에 적용 가능합니다.
이 application note는 Exgene™ Plant SV maxi를 사용하여 염생식물의 한 종류인 세발나물(Spergularia marina)에서 genomic DNA를 추출한 후 수율, 순도 측정 및 전기영동을 통해 추출된 genomic DNA를 분석한 내용입니다. 본 application note는 염생식물 내에서 핵산 추출 효율을 감소시키는 주요 원인인 다량의 염(salt)과 다당류(polysaccharide)를 제거하기 위한 커스텀 프로토콜 적용 방법에 대한 내용이며, 표준 프로토콜로 DNA를 추출한 결과 비교하여, 추출된 DNA의 수율과 순도에 어떤 차이가 있는지를 평가하였습니다.
APPLICATIONS
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- Agriculture, Plant and Fishery
