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Environmental:
Flesh fly genomic DNA - 곤충학은 곤충의 형태, 생리, 발생 및 유전적 특성을 연구하는 학문으로, 환경생태학과 도시생태학은 물론 질병 매개 곤충의 검역, 법의학 등 다양한 분야에서 폭넓게 활용되고 있습니다. 특히 곤충의 발생학적 특성이나 종 간 유연관계를 규명하기 위해 유전자를 추출·분석하는 분자생물학적 기법이 널리 적용되고 있으며, 이러한 접근법은 형태적 구분이 어려운 종을 정확하게 동정하는 데 중요한 역할을 합니다. DNA 바코딩은 이러한 유전자 기반 종 동정 기법 중 하나로, 곤충 분류 및 응용 곤충학 연구에서 표준적인 분석 도구로 활용되고 있습니다.
AllEx® 64 자동화 핵산 추출 시스템은 magnetic bead 기반의 workflow를 통해 genomic DNA를 고처리량으로 정제할 수 있도록 설계되었으며, 우수한 재현성을 제공합니다. 최적화된 시약 조성과 자동화된 추출 공정을 통해 사용자 의존적 변이를 최소화하고, 다양한 생물학적 시료로부터 안정적인 DNA 회수가 가능합니다.
본 Application Note에서는 AllEx® 64 자동화 핵산 추출 시스템을 이용하여 flesh fly 시료로부터 genomic DNA를 추출하고, DNA 바코딩 기반 종 동정 가능성을 평가하였습니다. 종 동정을 위해 확보된 시료는 pupa 및 larva 단계의 개체이며, 추출된 DNA를 대상으로 PCR 증폭 및 염기서열 분석을 수행하였습니다. 본 사례는 곤충 시료에 대한 자동화 핵산 추출 시스템의 적용 가능성을 제시하며, DNA 바코딩을 활용한 종 동정 실험뿐만 아니라 곤충학 연구자들의 분자유전학적 연구에 대한 활용 가능성을 판단하는 데 참고 자료로 활용될 수 있을 것으로 기대됩니다.
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