진올바이오테크놀러지 (GeneAll Biotechnology)

05 Performance Improvement: Exgene™ Blood SV: 분자 진단 기법의 발달과 함께 혈액 내 존재하는 다양한 유전 정보는 각종 감염 또는 유전 질환, 종양 등을 예후 판별하거나 조기 진단 등 다양한 분야에서 활용되고 있습니다. 활용되는 분야가 확장됨에 따라 양질의 핵산을 확보하는 기술 또한 중요 요소가 되었습니다.
Exgene™ Blood SV는 혈액, 타액, 면봉 등 다양한 샘플로부터 고품질의 DNA를 추출하기 위한 제품입니다. 추출된 DNA는 혈액 연구, 질병 진단 검사 등에 활용되는 PCR, NGS, sequencing 등 다양한 downstream application에 적용할 수 있습니다.
본 application note는 성능이 개선된 Exgene™ Blood SV mini를 이용하여 human whole blood로부터 genomic DNA를 추출 후 수율 및 순도 측정, 전기영동 및 real-time PCR을 통해 성능을 평가한 내용입니다. 개선된 제품에 대한 추출 성능 비교를 위해 기존 제품과 타사의 매뉴얼 핵산 추출 키트와 함께 결과를 비교했습니다.

Application Notes: Genomic DNA Extraction from whole blood samples using upgraded Exgene™ Blood SV mini

Products: Exgene™ Blood SV mini

04 Performance evaluation: cfDNA: 세포 유리 DNA(cell-free DNA; cfDNA)는 세포에서 유리되어 혈액을 통해 자유롭게 순환하는 DNA를 의미합니다. 1977년, 암 환자의 혈액에서 cfDNA 농도가 정상인보다 높다는 연구 결과가 발표되면서 cfDNA의 유용성이 주목받기 시작했습니다. 이후 분자검사 기법의 발전과 함께 cfDNA는 순환 종양 핵산 검사, 종양 내 이질성 검사, 유전자 변이 추적 등 다양한 임상검사 및 분자 진단검사에 활용되고 있습니다.
cfDNA는 액체 생검(liquid biopsy)에서 혈장, 혈청, 소변 등 다양한 체액에서 추출할 수 있지만, cfDNA의 양이 적고 추출 후 downstream application에서의 안정성이 문제가 될 수 있습니다. 따라서 cfDNA에 특화된 추출 기술과 안정적인 downstream application 수행 여부는 매우 중요합니다.
본 실험은 cfDNA 추출에 특화된 Exgene™ cfDNA SV mini와 타사 cfDNA 추출 키트를 사용하여 암환자의 혈장 및 혈청으로부터 cfDNA를 추출한 후, downstream application의 수행을 통해 추출 키트 성능을 평가한 내용입니다.
Exgene™ cfDNA SV mini는 혈장, 혈청, 소변 등 비침습적 액체 생검 시료에서 cfDNA 추출에 최적화된 제품입니다. 적은 양의 시료에서도 cfDNA를 유기용매 사용 없이, 전처리 과정 없이 안전하게 추출할 수 있으며, 안정적으로 downstream application에 적용되도록 설계된 제품입니다.

Application Notes: Extraction of cfDNA from cancer plasma & cancer serum using Exgene™ cfDNA SV mini and detection of specific genes

Products: Exgene™ cfDNA SV mini

03 Performance evaluation: Blood DNA: 혈액을 원심 분리할 경우 분리되는 성분 중 연막층(buffy coat)은 주로 백혈구와 혈소판으로 구성되어 있으며 전체 혈액의 약 1% 미만을 구성합니다. 이 중 백혈구는 골수 내 조혈모세포에서 생성되고 성숙하게 되면 혈액으로 유입되어 외부 물질에 대해 신체를 보호하는 면역 활동을 수행합니다. 생명활동 유지를 위해 다양한 성분으로 구성된 혈액은 유전자 접근 방법을 활용한 생명 연구 및 진단 검사 분야에서 주로 사용되는 검체 중 하나입니다.
혈액 성분인 hematin, hemoglobin, 혈장 단백질 및 기타 물질들은 유전자적 접근 방법을 활용한 연구 또는 진단 검사 시 inhibitor로 작용할 수 있으므로 핵산 추출 단계에서 반드시 제거되어야 합니다. 또한 혈액에서 고품질의 핵산을 추출하는 것은 성공적인 연구 및 진단 검사를 위한 중요한 과정 중 하나입니다.
GenEx™ Blood Sx는 다양한 혈액 검체로부터 고품질의 gDNA를 추출하고 혈액 내 inhibitor 요소를 제거하는 ‘Special Buffer System’으로 구성된 제품이며, human whole blood 및 buffy coat(PBMC)를 대상으로 GenEx™ Blood Sx를 이용하여 genomic DNA를 추출한 후 yield, purity 측정 및 real-time PCR을 통해 성능 평가를 수행한 내용입니다.

Application Notes: Genomic DNA extraction with GenEx™ Blood from human whole blood and buffy coat (PBMC) isolated from human whole blood

Products: GenEx™ Blood

02 Performance evaluation: Blood DNA: 혈액은 생물의 혈관을 통해 흐르는 체액을 의미하며, 생명활동 유지에 필요한 영양소와 산소를 운반 및 공급을 하는 중요한 역할을 합니다.
접근성이 뛰어난 혈액은 비교적 쉽게 체외로 biopsy가 가능하기 때문에 임상 시험, 면역 연구, 질병 연구 및 치료제 개발 등을 비롯하여 건강검진, 체외진단 및 친자 확인 등 다양한 의료, 의학, 법의학 분야에서 이상적인 검체로 수행되고 발전되어 왔습니다.
이 application note는 서로 다른 혈액 표본 4가지 유형에서 genomic DNA를 추출하기 위해 자동화 핵산 추출 장비인 GENTi™ 32 Advanced Automatic Nucleic Acid Extraction Equipment와 blood sample에 특화된 GENTi™ Advanced Blood DNA Extraction Kit가 사용되었으며, 성능 평가를 목적으로 작성되었습니다.

Application Notes: Blood gDNA Extraction from Various Blood Specimen Types using GENTi™ Advanced Blood DNA Extraction Kit

Products: GENTi™ 32 Advacned Automatic Extraction Equipment

GENTi™ Advanced Blood DNA Extraction Kit

01 Forensic samples: Genomic DNA: 현대 수사기관은 과학수사(Forensic Science)를 토대로 물적 증거(물증)을 통해 범죄 행위를 입증하고 있습니다. 물적 증거 수집은 CCTV/범죄도구 확보 뿐만 아니라 혈흔, 머리카락, 지문 및 타액 등의 주요 forensic sample을 채취하고 DNA를 추출하여 결정적인 증거를 확보하기 위한 행위를 말합니다. 그 중, forensic sample이 범죄 사실의 결정적 증거가 될 수 있는 이유는 생명체의 DNA가 고유한 genotype(유전형)을 가지는 과학적 근거를 바탕으로 유전자분석을 통해 용의자를 특정할 수 있기 때문입니다. 이를 기반으로 사건의 현장에서 발견된 forensic sample의 유전자 분석을 통해 범죄 사실 입증이 가능하게 됩니다. Forensic sample은 수집 및 처리에 전문성을 요구하고, 극소량의 DNA를 가진 경우가 많아 추출이 어려운 sample 중 하나입니다.
이 내용은 다양한 forensic sample을 GENTi™ Advanced Blood DNA Extraction Kit를 이용하여 genomic DNA의 농도와 순도를 측정 후, 추출된 DNA를 template로 real-time PCR을 진행한 결과입니다. 미량의 혈액에서 DNA 추출이 가능한 GENTi™ Advanced Blood DNA Extraction Kit를 극소량의 forensic sample에 적용이 가능한지 확인한 실험 결과입니다.

Application Notes: Genomic DNA Extraction from Diverse Forensic Samples using GENTi™ Advanced Blood DNA Extraction Kit on GENTi™ 32 Advanced Automatic Extraction System

Products: GENTi™ 32 Advanced Automatic Extraction Equipment

GENTi™ Advanced Blood DNA Extraction Kit

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